第二季（第52集至103集）延續首季風格，講述Keroro小隊在藍星的搞笑日常生活。除了K隆星人的侵略日常外，本季加入了更多身世解密、全新外星勁敵，以及K隆星本部介入的精彩篇章。
- 導演
- 佐藤順一、山本裕介
- 聲優
- 中田讓治、子安武人、川上倫子、齋藤千和、渡邊久美子、小櫻悅子
選集 全 52 集
- 1Keroro 再次立足於大地之上！／Tamama 黑暗Tamama免費
- 2Keroro 侵略寶藏大作戰！／安哥爾．摩亞！賞花MORE．MORE！
- 3冬樹 你說我是名偵探嗎？／Dororo 復活的戰士！
- 4Giroro 甦醒的戰士！／冬樹 游吧游吧鯉魚旗！
- 5夏美＆小雪 網球場上的公主！／Keroro 侵略情勢大好的五月晴天！
- 6Dororo 我們要展開反擊！／巨大青蛙對南海大怪獸！
- 7Keroro 自動販賣機侵略計畫！／Tamama 覺醒！新必殺技！
- 8Keroro 長大吧城堡！／Keroro的移動城堡！
- 9Keroro KeroKero機器大賽跑！／Keroro 睡美人想要好好睡覺？
- 10冬樹 神秘的轉學生美少女發生了什麼事？／夏美＆三郎 無法回頭的兩人！
- 11桃華＆夏美＆摩亞 怪盜More Peach Summer！／Keroro 必勝！水中大決戰！
- 12Keroro 教師GeroGero故事！／Keroro 又見面了！父親大人！
- 13Keroro 能吸的話就吸吧！騙人，我不幹了／Dororo 走出精神的創傷
- 14Keroro 向藍星怒吼吧／Tamama K隆星來的訪客
- 15Giroro 愛的拯救大作戰／夏美＆小雪 心跳不已的第一次約會
- 16冬樹＆桃華 秘密的神秘約會／Keroro 喂，我們來做遊戲吧
- 17Keroro 大改造！戲劇性的大革新／Dororo 拜見！宿命的對決
- 18夏美跟冬樹的神隱！／Keroro 慣例！盛夏的搞笑對抗賽！
- 19K隆星人對藍星人 終於要全面對決？／小雪 心驚膽跳第一次做飯糰！
- 20超壞！麻煩！宇宙忘記寫作業大王傳說！
- 21Keroro 料理鐵人的挑戰書／Tamama 最強戰士的挑戰書的說
- 22冬樹 198X‧我們的暑假
- 23啊，嚇死人～特別企劃，GeroGero三十分鐘
- 24桃華 覺醒！第三個桃華
- 25Keroro小隊！帶我去月球吧
- 26Tamama！真的要結婚嗎？
- 27Keroro！要尋找寶物果然只能到金銀島去吧！
- 28冬樹！運動會絕不放棄！／Giroro！連貓都知道了
- 29Keroro！唉呀～離家出走還真是寂寞呢！
- 30Giroro 臉紅而且有毅力的陪在你身邊！／戰鬥吧小雪！為了保護重要的人！
- 31623要不要上我的Radio？／Keroro對夏美 1／6模型大戰！
- 32Keroro 混浴露天溫泉殺人事件！以下省略！／Kururu 超級討厭的傢伙！
- 33桃華 在宇宙吃個午餐好嗎／Keroro 獵松茸！
- 34Keroro 轉一下就交換身份／夏美 要是成為魔法少女的話…
- 35夏美＆冬樹 惡魔棲息的日向家／Keroro！成為超級大英雄吧
- 36Keroro 祝！生日快樂／摩亞 摩亞夢遊仙境
- 37DASONU MASO 藍星被我弄到手了！老實說我一點也不想要
- 38Giroro 擁有七種面貌的男人／冬樹 盛況空前的超自然現象大會
- 39Keroro 說不出Merry Christmas這句話
- 40Keroro 新年新Keroro誕生／小雪 外婆來了
- 41Keroro小隊 將愛心施放到空中／桃華對摩亞 激烈的羽板球大賽
- 42夏美 入侵！秘密基地／日向秋 大概是宇宙最強的女人吧
- 43Karara＆Taruru 藍星我們就收下了！
- 44夏美 Giroro凋零？拯救Giroro大作戰
- 45More Peach Summer Snow 決戰情人節／Keroro 全世界最不幸的故事
- 46桃華 名為”強敵”的朋友／Keroro＆冬樹 兩個人一起…
- 47桃華 私奔大作戰／Dororo與小雪 第一次相遇的回憶
- 48夏美 名犬小夏／Keroro 頑皮Kero派
- 49Keroro 本官是誰？你們又是誰？
- 50Keroro小隊 藍星靜止之日！？
- 51Keroro小隊 藍星！！走向滅亡的愛之星球！！
- 52Keroro小隊 真心獻給你
